IN470 - Metodi Computazionali per la Biologia - AA 2016-2017

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Annunci e comunicazioni relative al corso


Jan 12 2017 - Lezione conclusiva
L'ultima lezione si terra' giorno 12 gennaio 2017 alle ore 14 in laboratorio. A quelli di voi che possono, chiederei di portare il computer personale per aggirare le limitazioni del laboratorio.
Dec 22 2016 - Lezione
La lezione di oggi giovedi' 22/12 si terra' la mattina dalle 9 alle 11 in laboratorio piuttosto che il pomeriggio dalle 14 alle 16 in aula 311.
Dec 21 2016 - Materiale didattico
Le slides della lezione di ieri martedi' 20.12.2016 (12.1-mathModeling.pdf) e della lezione di domani giovedi' 22 (12.2-cellular-automata.pdf) sono disponibili al solito posto.
Dec 15 2016 - Materiale didattico
Le slides della lezione di oggi giovedi' 15.12.2016 (10.1-graphs.pdf e 11.1-netbiol.pdf) sono disponibili al solito posto. Nella cartella 'materiale' trovate anche 2 articoli (a11_Nat_Rev_Genet_2004_Barabasi.pdf e a11_Nature_2000_Albert.pdf) per approfondire l'argomento.
Dec 5 2016 - Materiale didattico
Le slides della lezione di domani martedi' 6.12 (9.1-ML.pdf e 9.2-NN.pdf) sono disponibili al solito posto.
Dec 1 2016 - Materiale didattico
Le slides della lezione di oggi giovedi 1.12 (8.1-phylogenetic-analysis.pdf) sono disponibili al solito posto.
Nov 26 2016 - Materiale didattico
Le slides della lezione di giovedi 24.11 (7.5-HMM.pdf) sono disponibili al solito posto.
Nov 22 2016 - Materiale didattico
Le slides della lezione di oggi (7.3-multalignment.pdf e 7.4-banche-dati.pdf) sono disponibili al solito posto.
Nov 17 2016 - Materiale didattico
Il materiale relativo alla lezione di oggi (7.2-stringSearching.pdf) e' disponibile al solito posto. Nella dir 'materiale' trovate l'articolo originale di Boyer-Moore sull'algoritmo (a7_boyer-moore-algorithm.pdf).
Nov 15 2016 - Materiale didattico
Il materiale relativo alla lezione di oggi (7.1-pairwisealignment.pdf) e' disponibile al solito posto.
Nov 10 2016 - Lezione
La lezione di oggi si terra' in laboratorio
Nov 7 2016 - Avviso di Seminario
Matthew He Nova Southeastern University, Ft. Lauderdale, Florida, USA Titolo: SYNERGY BETWEEN BIOLOGY AND MATHEMATICS: PAST, PRESENT, AND FUTURE. Lunedi' 07 Novembre 2016 ORE 14:30 Dipartimento di Matematica e Fisica Universita' degli Studi Roma Tre Largo San Leonardo Murialdo,1 - Pal.C Aula 311 Abstract The outline of this talk includes three phases of the synergy between biology and mathematics: Part 1 The Past - The Motion of the Heart and Blood in Animals (Harvey 1847) - Discovery of Genes (Mendel 1866) - Biological Problems that Stimulated Mathematics - Ten Equations that Changed Biology Part 2 The Present - The Landscapes of Biological Sciences - The Landscapes of Applied Mathematics - The Landscapes of Research in Biology and Mathematics - Bioinformatics of Mathematics: Theory, Methods, and Applications Part 3 The Future - Potential Problems - Meeting the Challenges: Education Across the Biological, Mathematical and Computer Sciences - A New Biology Curriculum for the 21st Century - Ten Challenges in the Synergy Between Biology and Mathematics
Nov 3 2016 - Materiale didattico
E' possibile reperire il materiale relativo alla lezione di oggi (6.1-stochasticproc.pdf e 6.2-randomwalks.pdf). Scaricare inoltre il doc esercitazioni/a6_RandomWalk-lab.pdf che useremo in laboratorio. Infine leggere il documento materiale/a6_berg_randomwalk_ch1.pdf.
Oct 25 2016 - Materiale didattico
E' possibile reperire il materiale relativo alla lezione di oggi (5.1-information.pdf e 5.2-diversity.pdf) insieme a due articoli da leggere (a5_Shannon ...) al solito posto.
Oct 20 2016 - Lavoro di gruppo
Nella cartella contenente il materiale del corso potete trovare 4 articoli di review (a4_....pdf) su argomenti differenti dell'ambito della systems biology. Sceglietene uno e leggetelo; giovedi' prossimo lo esporrete al resto della classe. In particolare identificate l'obiettivo dello studio, i metodi utilizati e i risultati ottenuti. Indicate la cosa che ha suscitato maggiormente il vostro interesse e perche'.
Oct 20 2016 - Assenza del docente
La lezione del 20 Ottobre non si terra' a causa dell'assenza del docente.
Oct 18 2016 - Materiale didattico
E' possibile reperire il materiale relativo alla lezione di oggi (4.1-probability.pdf) al solito posto.
Oct 13 2016 - Materiale didattico
E' possibile reperire il materiale relativo alla lezione di oggi (3.3-biology.pdf) insieme ad un articolo da leggere (a3_Gardner_PhysLifeRev_2005.pdf) al solito posto.
Oct 6 2016 - Materiale didattico
E' possibile reperire il materiale relativo alle lezioni del 4 e del 6 ottobre nella directory /users/castigli/IN470-2016 del server di laboratorio: 3.1-biology.pdf + 3.2-biology.pdf
Sep 29 2016 - Materiale didattico
Le slides della lezione di oggi (2.1-IntroSysBio.pdf) sono disponibili al solito posto.
Sep 27 2016 - Materiale didattico
E' possibile reperire il materiale relativo alla lezione del 27 settembre nella directory /users/castigli/IN470-2016 del server di laboratorio: 1.1-forewords-intro.pdf 1.2-algorithms.pdf
Sep 27 2016 - Inizio lezioni
La prima lezione del corso IN470 si terra' giorno 27 Settembre alle ore 14 nel Laboratorio di Informatica;