IN470 - Metodi Computazionali per la Biologia - AA 2020-2021

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Annunci e comunicazioni relative al corso


Dec 18 2020 - Materiale didattico
Le slides della lezione di oggi (11.2-CellularAutomata.pdf) sono disponibili nella sezione Class Material di Microsoft Teams. Nella cartella 'Altro Materiale' trovate anche il libro di von Neuman 'Theory of self reproducing automata' da sfogliare per cultura generale (a_11_Theory-of-self-reproducing-automata.pdf).
Dec 7 2020 - Comunicazione
NOTA BENE: Mercoledi' 9 e Lunedi' 14 Dicembre non faremo lezione.
Dec 7 2020 - Materiale didattico
Le slides della scorsa lezione (10.1-netbiol.pdf) sono disponibili nella sezione Class Material di Microsoft Teams. Anche le slides della lezione di oggi (11.1-MathModeling.pdf) sono disponibili al solito posto.
Dec 5 2020 - Materiale didattico
Le slides della lezione di ieri 4 Dicembre 2020 (9.1-graphs.pdf) sono disponibili nella sezione Class Material di Microsoft Teams.
Nov 23 2020 - Comunicazione
NOTA BENE: Venerdi' 27 Novembre e lunedi' 30 novembre non faremo lezione. Riprenderemo mercoledi' 2 dicembre.
Nov 23 2020 - Materiale didattico
Le slides della lezione di oggi (8.4-kmeans.pdf) sono disponibili nella sezione Class Material di Microsoft Teams.
Nov 20 2020 - Materiale didattico
Le slides della lezione di oggi 20 Novembre (8.3-NN.pdf) sono disponibili nella sezione Class Material di Microsoft Teams.
Nov 16 2020 - Comunicazione
Lunedi' 30 saro' assente e quindi non faremo lezione.
Nov 6 2020 - Comunicazione
La prossima settimana (Nov 9-13) le lezioni sono sospese come da calendario didattico. Come sapete noi non faremo l'esonero. Ci dovremmo quindi rivedere lunedi' 16 ma poiche' sono impegnato per un convegno ci vedremo mercoledi' 18.
Nov 5 2020 - Comunicazione
NOTA BENE: In seguito alla nuova normativa introdotta dal DPCM che introduce nuove restrizioni per l'accesso ai locali dell'universita', l'ESONERO programmato per lunedi' prossimo 9 Novembre e' CANCELLATO (cioe' non si svolgera' in presenza e neanche in remoto).
Nov 2 2020 - Materiale didattico
Le slides della lezione di oggi lunedi' 2 novembre (8.1-ML.pdf e 8.2-HMMi.pdf) sono disponibili nella sezione Class Material di Microsoft Teams.
Oct 30 2020 - Materiale didattico
Le slides della lezione di oggi (7.1-phylogenetic-analysis.pdf) sono disponibili nella sezione Class Material di Microsoft Teams.
Oct 28 2020 - Comunicazione
Vista la situazione la lezione in laboratorio di mercoledi' avverra' in modalita' online salvo comunicazione contraria.
Oct 27 2020 - Materiale didattico
Le slides della lezione di lunedi' 26 ottobre (6.3-multalignment.pdf e 6.4-banche-dati.pdf) sono disponibili nella sezione Class Material di Microsoft Teams.
Oct 23 2020 - Materiale didattico
Le slides della lezione di oggi 23 ottobre (6.2-pairwisealignment.pdf) sono disponibili nella sezione Class Material di Microsoft Teams.
Oct 23 2020 - Comunicazione
Da lunedi' 26 ottobre le lezioni del lunedi' e del venerdi' si terranno unicamente in modalita' online (non in aula). Per qauel che riguarda il laboratorio di mercoledi' dipende dall'evoluzione della situazione e da cosa decidera' l'ateneo. Per adesso resta confermata la presenza per mercoledi' 28/10.
Oct 21 2020 - Materiale didattico
Le slides della lezione di questa settimana sul sequence alignment (6.2-pairwisealignment.pdf) sono disponibili nella sezione Class Material di Microsoft Teams.
Oct 19 2020 - Comunicazione
Per la lezione di mercoledi' 21 ottobre e' richiesto l'uso del computer (con un compilatore C installato, per es. gcc). E' consigliato l'uso dell'ambiente Unix/Linux. Coloro che intendono usare Windows dovranno installare Mingw (http://www.mingw.org) oppure cygwin (https://www.cygwin.com).
Oct 19 2020 - Materiale didattico
Le slides della lezione di oggi lunedi' 19 ottobre (6.1-stringSearching.pdf) sono disponibili nella sezione Class Material di Microsoft Teams.
Oct 16 2020 - Materiale didattico
Le slides della lezione di oggi venerdi' 15 ottobre (5.2-randomwalks.pdf) sono disponibili nella sezione Class Material di Microsoft Teams. Ho inoltre aggiunto i seguenti due documenti da leggere: a6_berg_randomwalk_ch1.pdf e a6_RandomWalk-lab.pdf. Di quest'ultimo leggere ed implementare l'esercizio proposto.
Oct 13 2020 - Comunicazione
Per la lezione di mercoledi' 14 ottobre e' richiesto l'uso del computer (con un compilatore C installato, per es. gcc). E' consigliato l'uso dell'ambiente Unix/Linux. Coloro che intendono usare Windows dovranno installare Mingw (http://www.mingw.org) oppure cygwin (https://www.cygwin.com).
Oct 12 2020 - Materiale didattico
Le slides della lezione di oggi lunedi' 5 ottobre (4.2-diversity.pdf e 5.1-stochasticproc.pdf) sono disponibili nella sezione Class Material di Microsoft Teams. Dentro la cartella 'Altro Materiale' trovate l'articolo Hill-1973.pdf che contiene parte della dimostrazione richiamata dalla lezione sulla diversity;
Oct 7 2020 - Materiale didattico
Le slides relative all'esercitazione di oggi (4.3-generating-random-samples.pdf) sono disponibili nella sezione Class Material di Microsoft Teams.
Oct 6 2020 - Materiale didattico
Le slides della lezione di ieri lunedi' 5 ottobre (3.3-biology.pdf) sono disponibili nella sezione Class Material di Microsoft Teams. Dentro la cartella 'Altro Materiale' trovate anche da leggere i seguenti articoli: 1) l'articolo di Shanon (a5_Shannon1950.pdf) sulla teoria dell'informazione; 2) cellular biology for engineers (a3_Khoshmanesh-CellBiol.pdf); 3) Reverse-engineering transcription control networks (a3_Gardner_PhysLifeRev_2005.pdf)
Oct 5 2020 - Comunicazione
Venerdi' 9 ottobre non faremo lezione. Per la lezione di mercoledi' 7 ottobre e' richiesto l'uso di un computer (con il compilatore C installato).
Oct 2 2020 - Materiale didattico
Le slides della lezione di oggi venerdi' 2/10 (3.2-biology.pdf) sono disponibili nella sezione Class Material di Microsoft Teams
Sep 30 2020 - Materiale didattico
Le slides della lezione di oggi mercoledi' 30 (4.1-information.pdf) sono disponibili nella sezione Class Material di Microsoft Teams
Sep 28 2020 - Materiale didattico
Le slides della lezione di oggi lunedi' 28 (3.1-biology.pdf) sono disponibili nella sezione Class Material di Microsoft Teams
Sep 25 2020 - Materiale didattico
Le slides della lezione di oggi venerdi' 25 (2.1-Intro-SysBio.pdf) sono disponibili nella sezione Class Material su MSTeams.
Sep 24 2020 - Materiale didattico
Le slides della lezione di mercoledi' (1.2-bioinfo-algorithms.pdf) sono disponibili nella sezione Class Material su MSTeams. Dentro la cartella 'Altro Materiale' trovate anche due letture facoltative (Interesting Careers That Combine Biology and Mathematics - Owlcation - Education.pdf e a1_Turing_Paper_1936.pdf)
Sep 21 2020 - Materiale didattico
Le slides della lezione di lunedi' (1.1-forewords-intro.pdf) sono disponibili nella sezione Class Material su MSTeams